El Museo Municipal de Guayaquil es un museo de Ecuador consagrado a las piezas arqueológicas, objetos y artículos históricos relacionados con la historia guayaquileña. Es considerado como el más importante de la ciudad y uno de los mejores del país. Está ubicado en el centro urbano de la ciudad de Guayaquil (Guayas), en el mismo edificio de la Biblioteca Municipal.
Paralelo a la Biblioteca, Pedro Carbo (en ese entonces Presidente de la Municipalidad), impulsó la creación del Museo Industrial en 1863. Fue el primero que tuvo la ciudad y que años más tarde, (en 1908) se convertiría en el Museo Municipal que conocemos hoy. El paso del Museo Industrial a municipal fue prácticamente una ampliación del espacio que ya existía.
Por eso, aunque se considera 1908 su año de creación, en realidad el Museo no estaría próximo a cumplir 100 años sino 146. Ello lo ubica como el museo más antiguo del Ecuador, estructurado como tal casi a mediados del siglo XIX.
El museo cuenta con un Auditorio y las siguientes salas:
Sala Pre-Hispánica I
Sala Pre-Hispánica II
Sala de la Colonia I
Sala de la Colonia II
Sala de la Independencia
Sala de la República
Sala del Siglo XX
Sala de los Presidentes
Sala de Numismática
Sala Polivalente
Sala de Arte Sacro
Sala de Arte Contemporáneo
Sala de Historia Natural
Sala de Exposiciones Temporales